Depuis le début du programme en 1989 dans les DOM et en 1995 en métropole, 3.5 millions de tests ont été faits; 5065 nouveau-nés ayant un syndrome drépanocytaire majeur (1/685 enfants testés) ont été dépistés par électrophorèse de l'hémoglobine. La fréquence de cette maladie varie selon les régions. Elle est plus fréquente dans les DOM (Guadeloupe 1/297, Martinique 1/343, Guyane 1/227) qu'en métropole : si la fréquence est 1/520 en Ile de France, elle est plus faible dans la majorité des autres régions.
Quelques faux négatifs (c'est-à-dire d'enfants atteints non repérés) ont été observés : il s'agissait d'enfants transfusés ou grands prématurés n'ayant pas eu leur test de contrôle nécessaire puisque le test à la naissance est moins fiable chez eux.
La fréquence des hétérozygotes A/S est de l'ordre de 2,8% (1/36) chez les enfants testés en métropole et de 4,8% (1/21) pour ceux des DOM (1/14 aux Antilles-Guyane).